業 績
ここでは著書、学術論文、翻訳等を掲載しています。
著書、学術論文、翻訳
(1)
著書：
1)
「特殊環境微生物の発見」（惣田昱夫・河合富佐子編）、合同出版(2009)、耐酸性菌・好酸性菌について（金原和秀）、pp. 107-120.
2)
「複合微生物系の産業利用と新産業創出」（倉根隆一郎監修）、シーエムシー出版(2006) 微生物細胞の蛍光染色と画像解析技術（下村有美、金原和秀）、pp.
35-41.
3) “Degradable Polymers and Materials” (K. Khemani
and C. Scholz, eds.), ACS(2006), Organization and expression of the genes
involved in the mtabolism of polyethylene glycol and polyvinyl alcohol (Kawai,
F., Tani, A., and Kimbara, K.), In, Chap. 22.
4) 「廃棄物処理・再資源化技術」、シーエムシー出版(2005)、微生物を用いたPCB無害化処理技術の開発（早川敏雄、金原和秀、小穴孝夫）、pp. 26-35.
5) 「環境修復と有用物質生産－環境問題へのバイオテクノロジーの利用－」、シーエムシー出版(2003)、バイオ技術によるＰＣＢ処理法（金原和秀、早川敏雄、志村稔、潮木知良、京谷隆）、pp. 158-164.
6) 「バイオレメディエーション実用化への手引き」（藤田正憲編）、リアライズ社(2001)、微生物によるＰＣＢの分解（金原和秀、古川謙介）、pp. 51-60.
7) 「植物と微生物による環境修復」（日本土壌肥料学会編）、博友社(2000)、微生物を用いたポリ塩化ビフェニルの分解－基礎と応用－（金原和秀）、pp. 101-124.
8) “Pseudomonas: biotransformations, pathogenesis, and evolving biotechnology” (Silver, S., Chakrabarty, A. M., Iglewski, B., and Kaplan, S. ed.), ASM, Washington, D.C.(1990), Molecular genetics of alginate biosynthesis in Pseudomonas aeruginosa (Zielinski, N. A., DeVault, J. D., Roychoudhury, S., May, T. B., Kimbara, K., Kato, J., Shinabarger, D. L., Kitano, K., Berry, A., Misra, T. K., and Chakrabarty, A. M.), pp. 15-27.
(2)
学術論文
A. 論文
1) Zhang, X., Tani, A., Kawai, F.,
and Kimbara, K.: Rapid and multiple in situ identification and analysis
of physiological status of specific bacteria based on fluorescent in situ
hybridization. J. Biosci. Bioeng., in press.
2) Arias-Barreiro, C. R.,
Okazaki, K., Koutsaftis, A., Inayat-Hussain, S. H., Tani, A., Katsuhara, M., Kimbara,
K., and Mori, I. C.: A Bacterial Biosensor for Oxidative Stress using the
Constitutively Expressed Redox-Sensitive Protein roGFP2. Sensors, 10, 6290-6306
(2010).
3) Iijima,
S., Shimomura, Y., Haba, Y., Kawai, F., Tani, A., and Kimbara. K.: Flow
Cytometry-Based Method for Isolating Live Bacteria with Meta-Cleavage Activity
on Dihydroxy Compounds of Biphenyl. J. Biosci. Bioeng., 109, 645-651 (2010).
4) Tani, A., Kawahara, T., Yamamoto,
Y., Kimbara, K., and Kawai, F.: Genes involved in novel adaptive
aluminum resistance in Rhodotorula glutinis. J. Biosci. Bioeng., 109, 453-458 (2010).
5) Tani, A., Inoue, C., Tanaka Y.,
Yamamoto, Y., Kondo, H., Hiradate, S., Kimbara, K., and Kawai, F.: The crucial role of mitochondrial regulation in
adaptive aluminum resistance in Rhodotorula
glutinis. Microbiology-SGM, 154, 3437-3446 (2008). (IF=2.841)
6) Somyoonsap, P., Tani, A., Jittima, C., Minami, T., Kimbara,
K., and Kawai, F.: Involvement
of PEG-carboxylate dehydrogenase and glutathione S-transferase in PEG
metabolism by Sphingopyxis macrogoltabida
strain 103. Appl. Microbiol. Biotechnol., 81, 473-484 (2008).
7) Tani, A., Somyoonsap, P., Minami,
T., Kimbara, K., and Kawai, F.: Polyethylene glycol
(PEG)-carboxylate-CoA synthetase is involved in PEG metabolism in Sphingopyxis macrogoltabida strain 103.
Arch Microbiol 189, 407-410 (2008).
8) Hu, X., Liu, X., Tani, A., Kimbara,
K. and Kawai, F.: Proposed oxidative metabolic pathway for polypropylene
glycol in Sphingobium sp. Strain PW-1. Biosci. Biotechnol. Biochem. 72,
1115-1118(2008).
9) Hu, X., Hirota-Mamoto, R.,
Fujioka, Y., Tani, A., Kimbara, K., and Kawai, F.: The pva operon is
located on the megaplasmid on Sphingopyxis
sp. strain 113P3 and is constitutively expressed, although expressed is
enhanced by PVA. Appl. Microbiol. Biotechnol., 78, 685-693(2008).
10)Hu, X.,Hirota-Mamoto, R.,
Shimomura, Y., Kimbara, K., and Kawai, F.: Cell surface structure
enhancing uptake of polyvinyl alcohol (PVA) is induced by PVA in the
PVA-utilizing Sphingopyxis sp. strain
113P3. Arch. Microbiol. 188, 235-241(2007).
11)Tani, A., Charoenpanich, J., Mori,
T., Takeichi, M., Kimbara, K. and Kawai, F.: Structure and conservation
of a polyethylene glycol-degradative operon in sphingomonads. Microbiology-SGM,
153, 338-346(2007).
12)Liu, X., Tani, A., Kimbara, K.
and Kawai, F.: Xenoestrogenic short ethoxy chain nonylphenol is oxidized by a
flavoprotein alcohol dehydrogenase from Ensifer
sp. strain AS08. Appl. Microbiol. Biotechnol., 73, 1414-1422(2007).
13)Hu, X., Fukutani, A., Liu, X., Kimbara,
K. and Kawai, F.: Isolation of bacteria able to grow on both polyethylene
glycol (PEG) and polypropylene glycol (PPG) and their PEG/PPG dehydrogenases.
Appl. Microbiol. Biotechnol., 73, 1407-1413(2007).
14)Yamada, T., Shimomura, Y., Hiraoka,
Y., and Kimbara, K.: Oxidative stress by biphenyl metabolites induces
inhibition of bacterial cell separation. Appl. Microbiol. Biotechnol., 73,
452-457(2006).
15)Charoenpanich, J., Tani, A.,
Moriwaki, N., Kimbara, K. and Kawai, F.: Dual regulation of a
polyethylene glycol degradative operon by AraC-type and GalR-type regulators in
Sphingopyxis macrogoltabida strain
103. Microbiology-SGM, 152, 3025-3034(2006).
16)Liu, X., Tani, A., Kimbara, K.
and Kawai, F.: Metabolic pathway of xenoestrogenic short ethoxy
chain-nonylphenol to nonylphenol by aerobic bacteria, Ensifer sp. strain AS08 and Pseudomonas
sp. strain AS90. Appl. Microbiol. Biotechnol., 72, 552-559(2006).
17)Shimomura, Y., Ohno, R., Kawai, F., and Kimbara,
K.: Method for assessment of viability and morphological changes of
bacteria in the early stage of colony formation on a simulated natural
environment. Appl Environ Microbiol. 72, 5037-5042(2006).
18)Hirota-Mamoto, R., Nagai, R.,
Tachibana, S., Yasuda, M., Tani, A., Kimbara, K. and Kawai, F.: Cloning
and expression of the gene for periplasmic poly(vinyl alcohol) dehydrogenase
from Sphingomonas sp. strain 113P3, a
novel-type quinohaemoprotein alcohol dehydrogenase. Microbiology-SGM, 152,
1941-1949(2006).
19)Ohta, T., Kawabata, T., Nishikawa, K., Tani,
A., Kimbara, K., and Kawai, F.: Analysis of amino acid residues involved
in catalysis of polyethylene glycol dehydrogenase from Sphingopyxis terrae,
using three-dimensional molecular modeling-based kinetic characterization of
mutants. Appl Environ Microbiol. 72, 4388-4396(2006).
20)Mukerjee-Dhar, G., Shimura, M.,
Miyazawa, D., Kimbara, K. and Hatta, T.: bph genes of the thermophilic PCB degrader, Bacillus sp. JF8: characterization of the divergent
ring-hydroxylating dioxygenase and hydrolase genes upstream of the Mn-dependent
BphC. Microbiology-SGM., 151, 4139-51(2005).
21)Klomklang, W., Tani, A., Kimbara,
K., Mamoto, R., Ueda, T., Shimao, M., and Kawai, F.: Biochemical and
molecular characterization of a periplasmic hydrolase for oxidized polyvinyl
alcohol from Sphingomonas sp. strain 113P3. Microbiology-SCM, 151,
1255-1262(2005).
22)Ohta, T., Tani, A., Kimbara, K.,
and Kawai, F.: A novel nicotinoprotein aldehyde dehydrogenase involved in
polyethylene glycol degradation. Appl Microbiol Biotechnol, 68, 639-646(2005).
23)Miyazawa
D, Mukerjee-Dhar G, Shimura M, Hatta T, Kimbara K.: Genes for Mn(II)-dependent NahC
and Fe(II)-dependent NahH located in close proximity in the thermophilic
naphthalene and PCB degrader, Bacillus sp. JF8: cloning and characterization.
Microbiology-SGM, 150, 993-1004(2004).
24)Yamada
T, Hiraoka Y, Ikehata M, Kimbara K, Avner BS, Das Gupta TK, Chakrabarty AM: Apoptosis or growth arrest:
Modulation of tumor suppressor p53's specificity by bacterial redox protein
azurin. Proc Natl Acad Sci U S A, 101, 4770-4775(2004).
25)Shimura, M., Hayakawa, T., Kyotani, T., Ushiogi, T., and Kimbara,
K.: Bioremediation of polychlorinated biphenyl contaminated sludge and
ballast. Proc. Inst. Mech.
26)Hatta, T., Mukerjee-Dhar, G., Damborsky, J., Kiyohara, H., and Kimbara, K.: Characterization of a novel thermostable Mn(II)-dependent 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase from a polychlorinated biphenyl- and naphthalene-degrading Bacillus sp. JF8. J Biol. Chem., 278, 21483-21492(2003).
27)Goto, M., Yamada, T., Kimbara, K., Horner, J., Newcomb, M., Das Gupta, T. K., and Chakrabarty, A. M.: Induction of apoptosis in macrophages by Pseudomonas aeruginosa azurin: tumor-suppressor protein p53 and reactive oxygen species, but not redox activity, as critical elements in cytotoxicity. Mol. Microbiol., 47, 549-559(2003).
28)Ohtsubo, T., Shimura, M., Delawary, M., Kimbara, K., Takagi, M., Kudo, T., Ohta,A., and Nagata, Y.: Novel approach to the improvement of biphenyl and polychlorinated biphenyl degradation activity: promoter implantation by homologous recombination. Appl. Environ. Microbiol., 69, 146-153(2003).
29)Hayakawa, T., Kyotani, T., Ushiogi, T., Shimura, M., and Kimbara, K.: Pilot plant study on PCB decomposition using a combination of phtodechlorination and biodegradation. J Environ. Biotech., 2, 127-133(2002).
30)Yamada, T., Goto, M., Punj, V., Zaborina, O., Kimbara, K., Das Gupta, T. K., and Chakrabarty, A. M.: The bacterial redox protein azurin induces apoptosis in J774 macrophages through complex formation and stabilization of the tumor suppressor protein p53. Infect. Immun., 70, 7054-7062(2002).
31)Yamada, T., Goto, M., Punj, V., Zaborina, O., Chen, M. L., Kimbara, K., Majumdar, D., Cunningham, E., Das Gupta, T. K., and Chakrabarty, A. M.: Bacterial redox protein azurin, tumor suppressor protein p53, and regression of cancer. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 99, 14098-14103(2002).
32)Hiraoka, Y., Yamada, T., Tone, K., Futaesaku, Y., and Kimbara, K.: Flow cytometry analysis of changes in the DNA content of the polychlorinated biphenyl degrader Comamonas testosteroni TK102: effect of metabolites on cell-cell separation. Appl. Environ. Microbiol., 68, 5104-5112(2002).
33)Iimura, Y., Ikeda, S., Sonoki, T., Hayakawa, T., Kajita, S., Kimbara, K., Tatsumi, K., and Katayama, Y.: Expression of a gene for Mn-peroxidase from Coriolus versicolor in transgenic tabacco generates potential tools for phytoremediation. Appl. Microbial. Biotechnol., 59, 246-251(2002).
34)Hiraoka, Y., and Kimbara, K.: Rapid assessment of the physiological status of the polychlorinated biphenyl degrader Comamonas testosteroni TK102 by flow cytometry. Appl. Environ. Microbiol., 68, 2031-2035(2002).
35)Sakai, M.,
Masai, E., Asami, H., Sugiyama, K., Kimbara, K., and Fukuda, M.:
Diversity of 2,3-dihydroxybiphenyl dioxygenase genes in a strong PCB degrader, Rhodococcus sp. strain RHA1. J. Biosci.
Bioeng., 93, 421-427(2002).
36)Ohtsubo, T., Delawary, M., Kimbara, K., Takagi, M., Ohta,A., and Nagata, Y.: BphS, a key transcriptional regurator of bph genes involved in polychlorinated biphenyl /biphenyl degradation in Pseudomonas sp. KKS102. J. Biol. Chem., 276, 36146-36154(2001).
37)Ohtsubo, T., Nagata, Y., Kimbara, K., Takagi, M., Ohta,A.: Expression of the bph genes onvolved in biphenyl/PCB degradation in Pseudomonas sp. KKS102 induced by the biphenyl degradation intermediate, 2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoic acid. Gene, 256, 223-228(2000).
38)Sugimoto, K., Senda, T., Masai, E., Kimbara, K., Fukuda, M., and Mitsui, Y.: Purification and crystallization of a catechol 2,3-dioxygenase PheB from Bacillus stearothermophilus BR219. Protein and Peptide Letters, 6, 403-406(1999).
39)Shimura, M., Mukerjee-Dhar, G., Kimbara, K., Nagato, H., Kiyohara, H., and Hatta, T.: Isolation and characterization of a thermophilic Bacillus sp. JF8 capable of degrading polychlorinated biphenyls and naphthalene. FEMS Microbiol. Lett., 178, 87-93(1999).
40)Peng, X., Egashira, T., Hanashiro, K., Masai, E., Nishikawa, S., Katayama, Y., Kimbara, K., and Fukuda, M.: Cloning of a Sphingomonas paucimobilis SYK-6 gene encoding a novel oxygenase that cleaves lignin-related biphenyl and characterization of the enzyme. Appl. Environ. Microbiol., 64, 2520-2527(1998).
41)Mukerjee-Dhar, G., Shimura, M., and Kimbara, K.: Degradation of polychlorinated biphenyl by cells of Rhodococcus opacus strain TSP203 immobilized in alginate and solution. Enzyme Microbial Technol., 23, 34-41(1998).
42)Mukerjee-Dhar, G., Hatta, T., Shimura, M., and Kimbara, K.: Analysis of changes in congener selectivity during PCB degradation by Burkholderia sp. strain TSN101 with increasing concentrations of PCB and characterization of the bphBCD genes and gene pdoducts. Arch. Microbiol., 169, 61-70(1998).
43)Shimura, M., Hayakawa, T., Mukerjee-Dhar, G., Fukuda, M., and Kimbara, K.: Characterization of polychlorinated biphenyl degradation in a fermentor by Comamonas testosteroni strain TK102. 日本水処理生物学会誌, 34, 57-65(1998).
44)Masai, E., Sugiyama, K., Iwashita, N., Shimizu, S., Hauschild, J. E., Hatta, T., Kimbara, K., Yano, K., and Fikuda, M.: The bphDEF meta-cleavage pathway genes involved in biphenyl/polychlorinated biphenyl degradation are located on a linear and separated from the initial bphACB genes in Rhodococcus sp. strain RHA1. Gene, 187, 141-149(1997).
45)Shimura, M., Koana, T., Fukuda, M., and Kimbara, K.: Complete degradation of polychlorinated biphenyls by a combination of ultraviolet and biological treatments. J Fermentation Bioeng., 81, 573-576(1996).
46)Hauschild, J. E., Masai, E., Sugiyama, K., Hatta, T., Kimbara, K., Fikuda, M., and Yano, K.: Identification of an alternative 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase in Rhodococcus sp. strain RHA1 and cloning of the gene. Appl. Environ. Microbiol., 62, 2940-2946(1996).
47)Senda, T., Sugiyama, K., Narita, H., Yamamoto, T., Kimbara, K., Fukuda, M., Sato, M., Yano, K., and Mitsui, Y.: Three dimensional structures of free form and two substrate complexes of an extradiol ring-cleavage type dioxygenase , the BphC enzyme from Pseudomonas sp. strain KKS102. J Mol. Biol., 255, 735-752(1996).
48)Seto, M., Masai, E., Ida, M., Hatta, T., Kimbara, K., Fukuda, M., and Yano, K.: Multiple polychlorinated biphenyl transformation systems in the Gram-positive bacterium Rhodococcus sp. strain RHA1. Appl. Environ. Microbiol., 61, 4510-4513(1995).
49)Seto, M., Kimbara, K., Shimura, M., Hatta, T., Fukuda, M., and Yano, K.: A novel transformation of polychlorinated-biphenyls by Rhodococcus sp. strain RHA1. Appl. Environ. Microbiol., 61, 3353-3358(1995).
50)Sugiyama, K., Narita, H., Yamamoto, T., Senda, T., Kimbara, K., Inokuchi, N., Iwama, M., Irie, M., Fukuda, M., Yano, K., and Mitsui, Y.: Crystallization and preliminary crystallographic analysis of a 2,3-dihydroxybiphenyl dioxygenase from Pseudomonas sp. strain KKS102 having polychlorinated biphenyl(PCB)-degrading activity. Proteins -Structure, Function, and Bioinformatics, 22, 284-286(1995).
51)Masai, E., Yamada, A., Healy, J. M., Hatta, T., Kimbara, K., Fukuda, M., and Yano, K.: Characterization of biphenyl catabolic genes of gram-positive polychlorinated biphenyl degrader Rhodococcus sp. strain RHA1. Appl. Environ. Microbiol., 61, 2079-2085(1995).
52)Sugiyama,
K., Senda, T., Narita, H., Yamamoto, T., Kimbara, K., Fukuda, M., Yano,
K., and Mitsui, Y.: Three-dimensional structure of a 2,3-dihydroxybiphenyl
dioxygenase(BphC enzyme) from Pseudomonas sp. strain KKS102 having
polychlorinated biphenyl(PCB)-degrading activity. Proc.
53)Fukuda, M., Yasukochi, Y., Kikuchi, Y., Nagata, Y., Kimbara, K., Horiuchi, H., Takagi, M., and Yano, K.: Identification of the bphA and bphB genes of Pseudomonas sp. strain KKS102 involved in degradation of biphenyl and polychlorinated biphenyls. Biochem. Biophys. Res. Commun., 202, 850-856(1994).
54)Kikuchi, Y., Nagata, Y., Hinata, M., Kimbara, K., Fukuda, M., Yano, K., and Takagi, M.: Identification of the bphA4 gene encoding ferredoxin reductase involved in biphenyl and polychlorinated biphenyl degradation in Pseudomonas sp. strain KKS102. J. Bacteriol., 176, 1689-1694(1994).
55)Nagata, Y., Hatta, T., Imai, R., Kimbara, K., Fukuda, M., Yano, K., and Takagi, M.: Purification and characterization of g-hexachlorocyclhexane(g-HCH) dehydrochlorinase(LinA) from Pseudomonas paucimobilis. Biosci. Biotech. Biochem., 57, 1582-1583(1993).
56)Kimbara, K., Iuchi, S., Fukuda, M., and Yano, K.: Construction of new enzymatic activity by changing of multicomponent enzyme. J Cellular Biochem., Supplement 17C, 192(1993).
57)平田彰, 保坂幸尚, 金原和秀: 第三級・エーテル構造化合物を含む難分解性産業廃水の生物処理. 水質汚濁研究, 14, 379-384(1991).
58)Roychoudhury, S., Zielinski, N. A., DeVault, J. D., Kato, J., Shinabarger, D. L., May, T. B., Maharaj, R., Kimbara, K., Misra, T. K., and Chakrabarty, A. M.: Pseudomonas aeruginosa infection in cystic fibrosis: biosynthesis of alginate as a virulence factor. Antibiot. Chemother., 44, 63-67(1991).
59)DeVault, J. D., Kimbara, K., and Chakrabarty, A. M.: Pulmonary dehydration and infection in cystic fibrosis: evidence that ethanol activates alginate gene expression and induction of mucoidy in Pseudomonas aeruginosa. Mol. Microbiol., 4, 737-45(1990).
60)Kato, J.,
61)Kimbara, K., and Chakrabarty, A. M.: Control of alginate synthesis in Pseudomonas aeruginosa: regulation of the algR1 gene. Biochem. Biophys. Res. Commun., 164, 601-608(1989).
62)Kimbara, K., Hashimoto, T., Fukuda, M., Koana, T., Takagi, M., Oishi, M., and Yano, K.: Cloning and sequencing of two tandem genes involved in degradation of 2,3-dihydroxybiphenyl to benzoic acid in the polychlorinated biphenyl-degrading soil bacterium Pseudomonas sp. strain KKS102. J. Bacteriol., 171, 2740-2747(1989).
63)Kimbara, K., Hashimoto, T., Fukuda, M., Koana, T., Takagi, M., Oishi, M., and Yano, K.: Isolation and characterization of a mixed culture that degrades polychlorinated biphenyls. Agric. Biol. Chem., 52, 2885-2891(1988).
B. 国際会議論文集
1) Flow
Cytometry and Cell-Sorting Method for Isolating Live Bacteria with Meta-Cleavage Activity on Dihydroxy
Compounds of Biphenyl,
Iijima, S., Shimomura, Y., Tani, A. and Kimbara, K.,
Asia Pacific Biochemical Engineering Conference,
2) MALDI-TOF/MS-based
phylogenic analysis of Methylobacterium
species collected from plant samples, Tani, A. and Kimbara, K., NIAES International
Symposium on Challenges for Agro-Environmental Research in Monsoon Asia,
3) Detection and assessment of
physiological activity of thermophilic bacteria during aromatic compounds
degradation, Kimbara, K., Iijima, S., Kanesaka, T., and Tani A., JSPS-NRCT
Asian Core Program Joint Seminar, Bangkok, Thailand, March 18-19, 2009.
4) Plant-growth promotion by
methylobacteria. Molecular basis of microbial one-carbon metabolism, Tani, A.,
Akita, M., Kawaguchi, K., Yurimoto, H., Sakai Y., Murase H., and Kimbara K.,
Gordon Conference, Bates college, Lewiston, ME, July 20-25, 2008.
5) Detection and assessment of
behavior of bacteria and construction of a method for isolation of bacteria
with specific functions, Kimbara, K., Iijima, S., Tanaka, A., Shintani,
M., Nojiri, H., and Kawai, F., The 24th RIB International Symposium.
6) Analysis of microbial floras in
Japanese tea field’s soils enriched with nitrogen fertilizers, Shimizu, Y.,
Morita, A., Narushima, M., Nakamura, Y., Kimbara, K., Kawai, F., The 3rd
International Conference on 0-Cha (Tea) Culture and Science,
7) Xenobiotic polymer-degradation by
Sphingomonads, Tani, A., Charoenpanich, J., Somyoonsap, P., Rimwangtragool, W.,
Minami, T., Kimbara, K., and Kawai, F., JSPS-NRCT Concluding Joint
Seminar, Nakhon Si Tammarat,
8) Detection and assessment of
physiological activity of bacteria in soil, Shimomura, Y., and Kimbara, K.,
9) Detection and assessment of
physiological change and cellular oxidation of bacteria by aromatic compounds
and metals, Kimbara, K., and Mori, I. C., 13th International
Symposium on Toxicity Assessment,
10)
Characterization
of genes for naphthalene degradation in the thermophilic naphthalene and PCB
degrader, Bacillus sp. JF8, Miyazawa,
D., Hatta, T. and Kimbara, K., The 5th JSPS-NRCT Joint
Seminar, Pattaya, Thailand, November 7-10, 2006.
11)
Detection
and assessment of physiological activity of bacteria in soil, Kimbara, K.,
Kawai, F. and Shimomura, Y., International Workshop on Biomonitoring of Global Environment,
Okayama, Japan, October 2, 2006.
12)
Detection
and assessment of physiological activity of bacteria in soil, Kimbara, K.,
Kawai, F. and Shimomura, Y., The 7th International Symposium on
Global Renaissance by Green Energy Revolution,
13) A detection method for GFP expressing Azoarcus sp. in sludge confocal microscope, Shimura M., Shimomura, Y., Kimbara, K., and Hayakawa, T., 11th International Symposium on Microbial Ecology, Vienna, Austria, August 20-25, 2006.
14) Detection and assessment of physiological activity of bacteria in soil, Shimomura, Y., Ohno, R., Kawai, F., and Kimbara, K., 11th International Symposium on Microbial Ecology, Vienna, Austria, August 20-25, 2006.
15) A method for quantitative analysis of viability of bacteria in the early stage of colony formation on a simulated natural environment, Shimomura, Y., Ohno, R., Kawai, F. and Kimbara, K., International Conference on Environmental Biotechnology, Leipzig, Germany, July 9-13, 2006.
16)
Crystal
structure of extradiol type dioxygenases –Comparison of reaction intermediate
structure and their implications-, Araki, Y., Senda, M., Sugimoto, K., Hatta,
T., Kimbara, K., Fukuda, M. and Senda, T., The 50th
Anniversary of Oxygenases,
17)
PCB
degradation by integrated physicochemical treatment and biodegradation –from
laboratory study to pilot scale-, Kimbara, K., Shimura, M. and Kawai,
F., The 3rd Asian Pacific International Conference on Poluutants and
Control, Bangkok, Thailand, December 12-15, 2005.
18)
Development
of a detection method for polychlorinated biphenyl degrader using biphenyl
derivatives, Haba, Y., Shimomura, Y., Shimura, M., Kawai, F. and Kimbara, K.,
10th International Congress on Pseudomonas,
19) Development of a method for detecting bacterial cells in soil, Shimomura, Y., Haba, Y., Shimura, M. and Kimbara, K., 10th Internal Symposium on Microbial Ecology, Cancun, Mexico, August 22-27, 2004.
20) Development of a method for detecting bacterial cells in soil, Shimomura, Y., Haba, Y., Shimura, M., Ohno, R. and Kimbara, K., 7th Internal Symposium of Environmental Biotechnology, Chicago, IL, USA, June 18-21, 2004.
21)
Analysis of bph genes cluster of psychrotrophic
PCB/biphenyl-degrading Burkholderia
sp. MEG1, Hatta, T., Suzuki, K., Shimura, M., and Kimbara, K.,
Pseudomonas 2003,
22)
Cloning and characterization of
Mn(II)- and Fe(II)-dependent meta-cleavage
enzymes from a thermophilic PCB-degrader Bacillus
sp. JF8, Miyazawa, D., Mukerjee-Dhar, G., Hatta, T., and Kimbara, K.,
American Society for Microbiology 103rd General Meeting,
23)
Hydrophobic patch of azurin is
important for its cytotoxicity, Yamada, T., Goto, M., Hiraoka, Y., Foley, D.
A., Kimbara, K., and Chakrabarty. A. M., American Society for
Microbiology 103rd General Meeting,
24)
PCB degradation by integrated
physicochemical treatment and biodegradation –from laboratory to pilot scale-,
Kimbara, K., Kyotani, T., Ushiogi, T., and Hayakawa, T., 12th
International Biodeterioration and Biodegradation Symposium,
25)
Induction of apoptosis in macrophages by two redox proteins from Pseudomonas aeruginosa, Yamada, T.,
Goto, M., Hiraoka, Y., Zaborina, O., Punj, V., Kimbara, K., and Chakrabarty, A. M.,
American Society for Microbiology 102nd
General Meeting, Salt Lake City, May, 2002.
26)
BphS, a key transcriptional
regulator of bph genes involved in PCB/biphenyl degradation in Pseudomonas sp. KKS102, Ohtubo, Y.,
Dlawary, M., Kimbara, K., Takagi, M., Ohta, A., and Nagata, Y.,
Pseudomonas 2001,
27)
Inhibition of bacterial cell
separation induced by intracellular oxidation caused by minohydroxy biphenyls,
Yamada, T., Hiraoka, Y., and Kimbara, K., Pseudomonas 2001, Brussels,
September, 2001.
28)
Cloninag and sequencing of lower pathway genes involved in
naphthalene metabolism from a thermophilic PCB-degrader Bacillus sp, Miyazawa, D., Ushiogi, T.,
Mukerjee-Dhar, G., Hatta, T., and Kimbara, K., JF8. American
Society for Microbiology 101st General Meeting, Orland, May, 2001.
29)
Flow cytometric analysis on cell cycle of a PCB-degrading bacterium Comamonas testosteroni TK102: effect of
metabolites on cell-cell separation, Hiraoka, Y., Yamada, T., and Kimbara, K.,
Fifth Internal Symposium on Environmental Biotechnology,
30)
Pilot plant study on PCB
degradation by integrated physicochemical treatment and biodegradation, Kimbara,
K., Kyotani, T., Ushiogi, T., Shimura, M., and Hayakawa, T., Fifth Internal Symposium
on Environmental Biotechnology,
31)
Cloninag and sequencing of lower pathway genes involved in
naphthalene metabolism from a thermophilic PCB-degrader Bacillus sp. JF8, Miyazawa, D., Mukerjee-Dhar, G., Shimura, M.,
Hatta, T., and Kimbara, K., Fifth Internal Symposium on Environmental
Biotechnology, Kyoto, July, 2000.
32)
Plasmid-encoded meta-cleavage
genes of the PCB-degrading thermophilic Bacillus
sp. JF8 appear to be organized into an operon and flanked by putative insertion
sequences, Mukerjee-Dhar, M., Hatta, T., and Kimbara, K., Fifth Internal
Symposium on Environmental Biotechnology, Kyoto, July, 2000.
33)
Pilot plant study on PCB
degradation by integrated physicochemical treatment and biodegradation, Kimbara,
K., Kyotani, T., Ushiogi, T., Shimura, M., and Hayakawa, T., Japan-UK
workshop on bioremediation, Tsukuba, September, 1999.
34)
Cell cycle analysis of a PCB degrading bacterium Comamonas testosteroni TK102 using flow
cytometry, Hiraoka, Y., and Kimbara, K., Pseudomona’99: Biotechnology
and Pathogenesis, Maui, September, 1999.
35) Pilot plant study on PCB degradation by integrated physicochemical treatment and biodegradation, Kimbara, K., Kyotani, T., Ushiogi, T., Shimura, M., and Hayakawa, T., The fifth international symposium on In situ and on-site bioremediation, San Diego, April, 1999.
(3)
翻訳：なし
(4)
その他
A. 学会口頭発表
1)
新規マイクロデバイスに形成された緑膿菌性バイオフィルムの共焦点レーザー走査型顕微鏡観察、狩山玲子，金原和秀，高野和潔，妹尾典久，大森啓士，光畑律子，桐田泰三，公文裕巳、第24回Bacterial
Adherence & Biofilm学術集会、東京、2010年7月9日．
2)
蛍光染色による生存率測定とFISH法を組み合わせた特定細菌の活性計測法、張弦，谷明生，金原和秀、環境バイオテクノロジー学会2010年度大会、仙台、2010.6.21-22．
3)
IncP-7群プラスミドの宿主域の解析、松井一泰、新谷政己、神原将希、谷明生、金原和秀、山根久和、野尻秀昭、日本農芸化学会2010年度大会、東京、2010年3月28-30日．
4) 新規マイクロデバイスを用いたバイフィルムの観察、金原和秀，狩山玲子，光畑律子，高野和潔，妹尾典久，大森啓士，桐田泰三，公文裕巳、日本生物工学会大会、名古屋、2009年9月23-25日．
5) フローサイトメトリを用いた代謝産物の蛍光に基づく微生物単離法の開発、飯島想，谷 明生，金原和秀、日本農芸化学会2009年度大会、福岡、2009年3月27-29日．
6) 土壌環境中の細菌の検出技術、金原和秀，飯島想，谷明生、日本生物工学会大会、仙台、2008年8月27-29日．
7) スナゴケの生育を促進する微生物、谷明生，秋田求，村瀬治比古，金原和秀、日本生物工学会大会、仙台、2008年8月27-29日．
8)
底泥と土壌からの微生物回収方法の検討、飯島想，下村有美，河合富佐子，金原和秀、環境バイオテクノロジー学会2007年度大会、大阪、2007.6.26-27．
9) 嫌気性ベンゼン分解菌Azoarcus sp. DN11のベンゼン分解と活性炭添加効果、下村有美，張弦，飯島想，河合富佐子，金原和秀、日本農芸化学会2007年度大会、東京、2007.3.25-27．
10)
フローサイトメトリを用いた土壌中のPCB分解微生物群集の解析、飯島想，下村有美，河合富佐子，金原和秀、第22回日本微生物生態学会、東京、2006.10.27-30．
11)
土壌微生物たちの生き様を探る、下村有美，大野隆造，金原和秀、日本農芸化学会2006年度大会，京都、2006.3.25-28．
12) バイオレメディエーションにおける微生物細胞モニタリング手法の開発、下村有美，大野隆造，金原和秀、化学工学会第37回秋季大会、岡山、2005年9月15-17日．
13) Biphenyl誘導体を用いたPCB分解菌検出法の開発、羽場洋介，下村有美，志村稔，河合富佐子，金原和秀、環境バイオテクノロジー学会2005年度大会、東京、2005年6月27-28日．
“その他２７件”
B. 解説：
1)
金原和秀、公文裕巳：バイオフィルム研究における基盤技術の開発、水環境学会誌、33:
100-105 (2010).
2)
飯島想、谷明生、金原和秀：土壌中の細菌の検出技術、生物工学会誌、87:
425-427 (2009).
3)
金原和秀、飯島想、下村有美、谷明生：土壌環境中の細菌の検出法、環境バイオテクノロジー学会誌、8(2):
81-87 (2008).
4)
金原和秀：環境微生物の生き様を探る、化学と生物、45: 869-875(2007).
5)
Kimbara, K.:
Recent Developments in the Study of Microbial Aerobic Degradation of Polychlorinated
Biphenyls. Microbes and Environments, 20,
127-134(2005).
6) 金原和秀、潮木知良、京谷隆、志村稔、早川敏雄：光脱塩素と生物分解のハイブリッド法によるPCB処理、生物工学会誌、82(2)、56-62(2004).
7) 金原和秀：ＰＣＢ処理（分解）技術の現状と展望、エコインダストリー、7(9)、5-9(2002).
8) 金原和秀、早川敏雄、志村稔、潮木知良、京谷隆：バイオ技術によるＰＣＢ処理法、エコインダストリー、7(9)、27-33(2002).
9) 川崎たまみ、早川敏雄、志村稔、金原和秀：鉄道における環境汚染浄化－生物機能の応用－、ＪＲＥＡ、45(8)、8-10(2002).
10) 金原和秀：ＰＣＢ汚染環境を修復する戦略－微生物による嫌気性脱塩素と好気的酸化分解の組合せで完全分解に見通し、化学と生物、40、291-293(2002).
11) 志村稔、金原和秀：生物を用いた土壌汚染モニタリング手法の開発、鉄道総研報告、16、47-50(2002).
12) Shimura, M., and Kimbara, K.: Toxicity assessment of environmental complex mixture in and around roadways. Quarterly Report of RTRI, 43, 41-44(2002).
13) 潮木知良、金原和秀：バイオ技術を用いたＰＣＢの無害化、ファインケミカル、30(19)、5-12(2001).
14) 金原和秀：廃棄物の適正処理と安全性評価、鉄道総研報告、15、1-4(2001).
15) 潮木知良、京谷隆、早川敏雄、金原和秀：バイオ技術を用いたＰＣＢ処理技術、鉄道総研報告、15、11-16(2001).
16) 京谷隆、志村稔、Gouri Mukerjee-Dhar、金原和秀：高温微生物を用いたＰＣＢの分解、鉄道総研報告、15、17-22(2001).
17) 川崎たまみ、早川敏雄、志村稔、金原和秀：環境安全性評価と汚染浄化への生物機能の応用、鉄道総研報告、15、23-26(2001).
18) 金原和秀、小穴孝夫、早川敏雄：微生物によるＰＣＢの分解、鉄道と電気技術、10(12)、18-22(1999).
19) 酒井晃三、香川晴治、濱田高義、金原和秀：微生物を用いたＰＣＢ分解処理技術、三菱重工技報、36、150-153(1999).
1) 金原和秀：微生物によるＰＣＢの分解－基礎研究から実用化へ－、化学工学、63、450-453(1999).
2) 小穴孝夫、金原和秀、酒井晃三、香川晴治、濱田高義：微生物を用いたＰＣＢ分解処理技術、化学装置、41(7)、58-62(1999).
20) 金原和秀：微生物によるＰＣＢの分解とトータル処理への応用、ブレインテクノニュース、73、8-12(1999).
21) 早川敏雄、小穴孝夫、金原和秀：微生物を用いたＰＣＢ無害化処理技術の開発、エコインダストリー、3(6)、5-14(1998).
22) 金原和秀：Bioremediation研究と実処理システムのミッシングリング、生物工学会誌、76、278(1998).
23) 永田裕二、金原和秀、高木正道：ＰＣＢを分解する微生物－環境汚染物質処理技術への応用を目指して－、現代化学、323、46-52(1998).
24) 志村稔、早川敏雄、金原和秀：生物を用いた環境モニタリング、鉄道総研報告、12、43-48(1998).
25) 金原和秀：紫外線照射と微生物分解を組み合わせたＰＣＢの無害化処理、環境管理、33、901-907(1997).
26) Mukerjee-Dhar, G., Shimura, M., Hayakawa, T., and Kimbara, K.: Detoxification of polychlorinated biphenyls by microorganisms. Quarterly Report of RTRI, 38, 155-160(1997).
27) 志村稔、早川敏雄、Gouri Mukerjee-Dhar、金原和秀：微生物を用いたＰＣＢ分解、鉄道総研報告、10、37-40(1996).
28) Shimura, M., Mukerjee-Dhar, G., and Kimbara, K.: A combined method for complete degradation of PCBs: combination of ultraviolet and biological treatments. Quarterly Report of RTRI, 37, 32-36(1996).
29) 金原和秀：微生物の環境適応とそのダイナミズム、生物工学会誌、72、39(1994).
30) 金原和秀：遺伝病と微生物－外部環境の刺激により変異株が出現－、化学と生物、28、697-699(1990).
C. その他：なし
特許、表彰、学位
(1)
特許：
1) 特許第3,930,295号（平19.6.13）：井上健治、内田敏之、遠藤崇彦、金原和秀、酒井晃三、浜田高義「有機塩素化合物含有機器の処理方法」
2) 特許第3,208,092号（平13. 7. 6）：金原和秀、志村稔、八田貴、清原法蔵「ポリ塩化ビフェニルの分解法と新規微生物」
3) 特許第3,023,304号（平12. 1.14）：小穴孝夫、金原和秀、Gouri Mukerjee-Dhar、志村稔「難分解性有機化合物の分解法と新規微生物」
4) 特許第2,967,950号（平11. 8.20）：高木正道、福田雅夫、金原和秀「ＰＣＢの分解方法」
5) 特許第2,706,718号（平 9.10.17）：金原和秀、橋本寿之、小穴孝夫、福田雅夫、高木正道、矢野圭司、大石道夫「微生物および微生物による物質分解方法」
(2) 表彰：
1) 東洋紡バイオテクノロジー財団、長期研究助成、昭和６３年４月
2) 社団法人日本電気鉄道技術協会、平成11年度鉄道電気技術賞、平成１２年５月
3) 財団法人八雲環境科学振興財団、環境研究助成、平成１８年３月
4) 国際環境バイオテクノロジーシンポジウム、ポスター賞、平成１８年６月
(3) 学位
博士(農学)東京大学大学院農学系研究科農芸化学専門課程
論文名 PCB分解菌の探索とその性質の検討及び分解系関与遺伝子の単離
７．教育実績
Ａ 担当授業科目名及び年度
人間環境特別講義第一（東京工業大学大学院）、平成１２～１５年度
総合理学特別講義（岡山理科大学大学院非常勤講師）、平成１４・１６・１９年度
微生物分子機能学（岡山大学大学院講義）、平成１６～２１年度
環境バイオテクノロジー（岡山大学学部講義）、平成１９～２０年
環境微生物学（岡山大学学部講義）、平成２１年
物質循環化学（静岡大学工学部講義）、平成２２年
Ｂ 大学院生の指導状況
前期課程
修士号取得9名、指導中1名
後期課程
博士号取得6名、指導中3名
1) 平岡義範「ポリ塩化ビフェニル（ＰＣＢ）の微生物生理に与える影響とその評価手法に関する基礎的研究」（東京工業大学、平成１４年３月）
2) 山田亨「Mechanism of p53-dependent Apoptosis Induced by Cupredoxin Azurin from Pseudomonas aeruginosa」（東京工業大学、平成１５年９月）
3) 宮沢大輔「好熱性細菌Bacillus sp. JF8の芳香族化合物代謝に関与する複数酵素遺伝子群に関する基礎的研究」（東京工業大学、平成１６年３月）
4) 下村有美「土壌微生物の検出と生理活性の評価手法に関する基礎的研究」（東京工業大学、平成１８年３月）
5) Peechapack Somyoonsap「Analysis of genes involved in peg operon and its surrounding regions」（岡山大学、平成２０年９月）
6) 飯島想「蛍光性代謝産物を指標とした環境微生物の迅速単離法の開発に関する基礎的研究」（岡山大学、平成２２年３月）
Ｃ 指導学生の受賞状況
1) 国際環境バイオテクノロジーシンポジウム、ポスター賞、平成１８年６月
2) 平成１９年度岡山大学大学院自然科学研究科学生奨励研究費助成、平成１９年４月
3) 日本農芸化学会中四国支部学生奨励賞、平成２０年３月
4) 平成２１年度日本生物工学会西日本支部学生賞、平成２１年１２月
７．教育に関する特記事項
なし
８．所属組織における運営実績
なし
９．運営に関する特記事項
なし
１０． 学会における活動
１）日本農芸化学会・中四国支部評議員（２００５年～２００９年）
２）環境バイオテクノロジー学会・幹事（２００５年～現在）
３）微生物生態学会・英文誌編集委員（２００５年～２００６年）
４）農業メタゲノム研究会・発起人（２００９年～現在）
米国微生物学会会員、化学工学会会員、日本生物工学会会員、極限微生物学会会員、ゲノム微生物学会会員
１１． 社会的活動
１）兵庫県「高砂西港盛立地のPCB汚染土に係る技術検討専門委員会」委員（２００６年～２００７年）
２）岡山理科大学「社会連携研究推進事業外部評価委員会」委員（２００８年）
１２． その他
研究開発したＰＣＢ処理法である「紫外線分解・生物処理法」が「ＰＣＢ処理技術調査検討委員会」（旧厚生省）にて基準化され、「廃棄物処理法」の改正に掲載され、平成12年10月1日に施工された。