- 環境バイオテクノロジー学会 優秀ポスター発表賞 （三本麗華、岡田崇、齋藤保久、二又裕之）
「微生物群集内コアメンバー間の相互作用変化が群集変遷を駆動する」2025年7月
- Best Poster Presentation Award, The 15th Asian Symposium on Microbial Ecology, 2025. Takumi Higashi, and Hiroyuki Futamata.
”Isolation of microrganisms involved with anaerobic propionate-degradation in a microbial fuel cell.”
- ISFAR-SU 2025 優秀発表賞 Mizuki Kanno, Hiroyuki Futamata, and Yosuke Tashiro 2025
Unlocking the interplay between biofilm dispersion and membrane vesicle induction in Pseudomonas aeruginosa ISFAR-SU 2025. 6th March (Shizuoka University, Hamamatsu).
- 日本細菌学会優秀発表賞 竹井奎多、羽田圭佑、菅野美月、二又裕之、田代陽介
バイオフィルム形成緑膿菌が産出する膜小胞へのリポトキシンの選択的封入 （姫路、2023年3月）
- 日本微生物生態学会優秀ポスター賞 菅野美月、二又裕之、田代陽介
「バイオフィルムの付着・成熟・脱離に関与する各因子と膜小胞形成の連関」 （札幌、2022年11月）
- 日本農芸化学会中部支部学術奨励賞 菅野美月、二又裕之、田代陽介
「緑膿菌バイオフィルムのライフサイクルに関与する因子と膜小胞産生の連関」 （名古屋、2022年10月）
- 生物工学会中部支部例会 優秀発表賞 本荘雅宏、鈴木研志、斎藤保久、武田和宏、木村元彦、石澤秀紘、田代陽介, 二又裕之
複合系の好適制御のために：Dry & Wet解析から見えてきた三菌株の安定的共存系の仕組み 2022年9月22日 愛知県名古屋市（名古屋大学）
- 第18回21世紀大腸菌研究会 優秀ポスター賞 菅野美月、二又裕之、田代陽介
バイオフィルムにおける膜小胞生産誘発因子の遺伝学的探索 2022年6月28日 富山県富山市（富山ステーションフロント）
- EMBO Workshop Bacterial membrane vedsicles: Biogenesis, functions, and medical application.
Excellent poster presentation prize. Identification of a factor promoting membrane vesicle release in a hypervesiculating bacterium Buttiauxella agrestis DSM4586T.
Nao Nakamichi, Ryota Moriuchi, Hideo Dohra, Hiroyuki Futamata, Yosuke Tashiro.2021年11月23-26日（つくば市）
- 環境バイオテクノロジー学会 トピックス賞
Buttiauxella属細菌における膜小胞過剰形成誘発遺伝子の同定
中道菜緒、森内良太、道羅英夫、二又裕之、田代陽介 2021年9月3日（静岡大学 on Web）
- 農芸化学会中部支部大会中部支部学術奨励賞
バイオフィルム由来膜小胞による免疫応答促進
髙原翠夏人，平山悟，中尾龍馬，二又裕之，田代陽介 2020年9月27日（名古屋大学 on Web）
- 農芸化学会2020年度大会ポスター発表選出
嫌気微生物の物質変換活性に及ぼす微生物蓄電性物質Mackinawiteの影響評価
安池一貴、工藤優輝、田代陽介、二又裕之 2020年3月24日（九州大学、福岡市）
- Best Presentation Award, in The organizers of Multidisciplinary English session:
Wisdom of Microbial Life, Fundamentals and Applications. “The microbial coexistence and functional stability corresponding to flexible metabolic network in a synthetic microbial ecosystem.”
Kenshi Suzuki, Azwani Fatma, Masahiro Honjo, Kensei Masuda, Koki Amamo, Yosuke Tashiro, Hiroyuki Futamata. 日本微生物生態学会第33回大会（山梨大学）(2019年9月12日)
- Best Presentation Award. The 5th International Symposium toward the future of advanced researches in Shizuoka University 2019.
Abd Rahman Jabir Mohd Din, Kenshi Suzuki, Masahiro Honjo, Ayaka Minoura, Kensei Masuda, Yosuke Tashiro, and Hiroyuki Futamata Coexistence mechanism in phenol degradation by two bacterial strains Commamonas testosteroni R2 and Stenotrophomonas sp. Y. March 6. 2019, Shizuoka (Shizuoka University).
- 膜シンポジウム学生賞 髙木航太郎、長谷川雄将、田原悠平、新谷政己、大熊盛也、宮田真人、二又裕之、田代陽介
「微生物による多層膜小胞分泌の機構解析」（2018年11月14日、神戸）
- 2018-ASM Outstanding Abstract Award. Kenshi Suzuki, Masahiro Honjo, Tomoka Nishimura, Kensei Masuda, Ayaka Minoura, Yosuke Tashiro, and Hiroyuki Futamata
Metabolic networks based on the substrate-spatiotemporal heterogeneity can organize coexistence of microbes 2018. June 7-11 Atlanta, USA.
- 2017年度 日本農芸化学会中部支部奨励賞 高木航太郎、長谷川雄将、二又裕之、田代陽介
微生物分泌性膜小胞を介した細菌細胞間の物質輸送システムの機構解析 2017年10月7日
- 環境微生物系合同大会2017 優秀ポスター賞 鈴木研志、本荘雅宏、西村朋香、ファティマ アズワニ、田代陽介、二又裕之
合成微生物生態系における異属菌株の共存と代謝 2017年8月30日 東北大学（宮城県仙台市）
- 第１８回静岡ライフサイエンスシンポジウム 優秀ポスター賞（高木航太郎、長谷川雄将、二又裕之、田代陽介）
微生物分泌性カプセルを介した細胞への物質運搬機構の解明 静岡ライフサイエンスシンポジウム 2017年3月5日 静岡大学（静岡県静岡市）静岡生命科学若手フォーラム
- 第１８回静岡ライフサイエンスシンポジウム 優秀ポスター賞（大堀尚子、青柳智、堀知行、羽部浩、田代陽介、二又裕之）
世界初かも？！環境汚染物質トリクロロエテンを分解する新しい微生物脱塩素化プロセス 静岡ライフサイエンスシンポジウム 2017年3月5日 静岡大学（静岡県静岡市）静岡生命科学若手フォーラム
- 日本生物工学会中部支部例会 日本生物工学会中部支部長賞受賞（鈴木渓、由井嵐士、久保田博子、安藤翔太、田代陽介、二又裕之）
「微生物燃料電池の可能性 〜微生物が創る未知の物質〜」 2016年8月5日 名古屋大学農学研究科（愛知県名古屋市）
- 膜学会2015年度大会ポスター賞（長谷川雄将、新谷政己、大熊盛也、金原和秀、二又裕之、田代陽介）
「微生物が分泌する細胞外ベシクルの特性および生理学的機能の解析」（2015年5月、東京）
- 第１６回静岡ライフサイエンスシンポジウム 優秀ポスター賞（由井嵐士、久保田博子、鈴木渓、餅原弘樹、細川拓也、田代陽介、二又裕之）
「微生物由来新規バイオマテリアルの物質科学的特性解析」 2015年3月7日
- 環境微生物系学会合同大会2014（微生物生態学会、土壌微生物学会、環境バイオテクノロジー学会の合同開催） 優秀ポスター賞（久保田博子、鈴木渓、千葉悠介、餅原弘樹、細川拓也、由井嵐士、田代陽介、二又裕之）
「蓄電性バイオナノマテリアル生成複合微生物系の解析」2014年10月23日
- 第22回日本生物工学論文賞 生物工学会 2014年9月9日
- 独立行政法人日本学術振興会（Japan Society for the Promotion of Science）科学研究費助成事業第１段審査委員表彰（約5300名から124名が選出）2013年10月31日
- The 17th Shizuoka Forum on Health and Longevity. Poster Presentation Award
(°Kei Suzuki, Rubaba Owen, Yoko Araki, Syuji Yamamoto, Hiroki Mochihara, Nozomi Yoshida, and Hiroyuki Futamata “Reuse and Reduce of Organic Waste: Characterization of Microbial Fuel Cell Capable of Generating Electricity from Organic Waste.”)2012年11月16日
- 日本土壌微生物学会 平成２０年度大会 優秀ポスター賞（二又裕之、提髪啓太、平石明
「フェノールを用いた連続集積培養系における微生物間相互作用の解析」）2008年6月13日
- 日本微生物生態学会 2006年度優秀論文賞
（Akira Hiraishi, Shinichi Kaiya, Hideki Miyakoda and Hiroyuki Futamata “Biotransformation of polychlorinated dioxins and microbial community dynamics in sediment microcosms at different contamination levels.”）